1. Información levantada ante el Gobernador y oficiales reales para averiguar el estado en que se hallaba la gente que Francisco Pizarro tenía en la Isla del Gallo. 29 de agosto de 1528. (1).

2. Declaración y traspaso que hizo don Hernando de Luque a favor del Licenciado Gaspar de Espinosa. 6 de agosto  de 1532. (41).

3. Carta del Licenciado de la Gama al Rey. 19 de julio de 1532. (44).

4. Carta del Licenciado Espinosa al Rey. 5 de agosto de 1532. (44).

5. Carta del Licenciado Espinosa al Rey, 20 de octubre de 1532. (49).

6. Carta de Francisco Pizarro al Rey. 1º de enero de 1535. (54).

7. Carta de Hernando Pizarro al Rey. 15 de noviembre de 1535. (58).

8. Carta del Tesorero Antonio Téllez de Guzmán al Rey. 5 de mayo de 1536. (60).

9. Real cédula a favor de Rodrigo Orgoños. 8 de septiembre de 1536. (62).

10. Las cosas que pasaron entre el Adelantado don Pedro de Alvarado y el Mariscal don Diego de Almagro. 25 de septiembre de 1536. (64).

11. Carta del Licenciado Pedro Vázquez, Juez de Residencia de Tierra Firme, al Consejo de Indias. 30 de noviembre de 1536. (75).

12. Información hecha por don Diego de Almagro, Adelantado del Cuzco, contra Hernando Pizarro. 20 de abril de 1537. (79).

13. Real cédula relativa a Diego de Almagro. 31 de mayo de 1538. (101).

14. Carta de Hernando Pizarro al Rey. 6 de julio de 1539. (102).

15. Cartas de Rodrigo Orgoños, interrogatorios y posiciones en el pleito seguido por el Fiscal Villalobos contra don Diego de Almagro y otros, sobre preferencia a los bienes secuestrados del Adelantado don Diego de Almagro por los delitos de rebelión. 1539. (103).

16. Doña Leonor de Becerra, viuda de Juan de Alvarado, vecina de la ciudad de Mérida, con Hernando Pizarro, sobre la muerte de Hernando de Alvarado, su hijo. 5 de mayo de 1540. (132).

17. Leonor de Zelinos, hermana del Adelantado don Diego de Almagro, y Diego de Sevilla, su primo, con Hernando Pizarro, sobre la muerte que ejecutó en el dicho Adelantado yendo de Gobernador. 15 de mayo de 1540. (137).

18. Proceso de Juan de Torres, vecino de la villa de Almodóvar, por sí y en nombre de Diego de Torres, su hijo, con Diego de Alvarado. 31 de mayo de 1540. (155).

19. Título de encomienda a favor del Capitán Martín Monje, otorgado por el Gobernador don Francisco Pizarro. 17 de septiembre de 1540. (168).

20. Fragmento de consulta del Consejo de Indias a Su Majestad. 20 de septiembre de 1540. (170).

21. Carta del Licenciado Villalobos al Rey, acerca del proceso que Hernando Pizarro hizo contra Almagro. 1º de octubre de 1540. (171).

22. Fragmento de consulta de los consejeros de Indias al Rey. 12 de diciembre de 1540. (174).

23. Carta de Felipe Gutiérrez a Su Majestad, exponiendo los perjuicios que le causa Gonzalo Pizarro y sobre la conveniencia de establecer una Audiencia en Lima. 30 de diciembre de 1540. (174).

24. Real cédula despachada a las justicias de Sevilla y Córdoba, para que reciban cierta información sobre el pleito entre Diego de Alvarado y Hernando Pizarro, sobre la muerte de don Diego de Almagro. 17 de febrero de 1541. (176).

25. Copia de una relación de lo que escribe a V. M. Hernando Pizarro. 19 de marzo de 1541. (177).

26. Real cédula ordenando a Pizarro de licencia para pasar a España a Juan Balza y a Juan de Herrada. 15 de abril de 1541. (180).

27. Real cédula sobre gratificación a los descubridores y conquistadores del Nuevo Reino de Toledo. 6 de julio de 1541. (181).

28. Real cédula para que se haga justicia en lo tocante a las deudas contraídas por los descubridores del Nuevo Reino de Toledo. 6 de julio de 1541. (182).

29. Informe del Fiscal de las Indias a Su Majestad acerca de varias materias relativas a don Alonso Enríquez. 13 de septiembre de 1541. (183).

30. Probanzas de Hernando de Sosa contra Hernando Pizarro. 24 de septiembre de 1541. (184).

31. Real cédula para que se averigüe y declare desde dónde comienzan los límites de la Nueva Toledo. 26 de octubre de 1541. (190).

32. Real cédula para que se den a Paulo Inga ciertos tributos. 28 de octubre de 1541. (191).

33. Real cédula para que se favorezca a Paulo Inga. 28 de octubre de 1541. (192).

34. Real cédula disponiendo que se nombre tutor a Paulo Inga. 29 de octubre de 1541. (193).

35. Real cédula confirmando a Paulo Inga la donación de cierto solar. 29 de noviembre de 1541. (193).

36. Real cédula para que en casa de Paulo Inga no se ponga ningún español sin su voluntad. 19 de noviembre de 1541. (194).

37. Real cédula para que se haga información acerca de cierto agravio hecho a Paulo Inga. 29 de noviembre de 1541. (195).

38. Real cédula sobre ciertos indios que Francisco Pizarro quitó a Paulo Inga. 29 de noviembre de 1541. (196).

39. Real cédula para que se haga averiguación acerca de los españoles que entran en casa de Paulo Inga, con malas intenciones. 29 de noviembre de 1541. (196).

40. Real cédula para que se deje a Juan de León al lado de Paulo Inga. 29 de noviembre de 1541. (197).

41. Real cédula para que se informe acerca de ciertos indios y tierras que solicita Paulo Inga. 29 de noviembre de 1541. (198).

42. Real cédula o provisión real en favor de Antón de Cerrada, dándole el derecho de usar escudo de armas. 24 de noviembre de 1541. (198).

43. Información del estado del Perú después de la muerte de Pizarro. Declaración de Juan Bautista Pastene. 12 de diciembre de 1541. (201).

44. Fe de cierta probanza y autos y escrituras de don Alonso Enríquez contra Hernando Pizarro. 19 de diciembre de 1541. (206).

45. Real cédula mandando que no se haga ejecución en los bienes del Adelantado don Diego de Almagro ni en los de su hijo. 15 de septiembre de 1542. (257).

46. Carta a S. M. de Ventura Beltrán, en que se refiere lo acaecido en el viaje que hizo Vaca de Castro desde Jauja al Cuzco, adonde iba con gente armada contra don Diego de Almagro, y la batalla y victoria que la gente de Vaca de Castro ganó de la de Almagro a 8 de octubre. 8 de octubre de 1542. (258).

47. Carta a S. M. de Juan de Cáceres, que dice haberse ganado la batalla de Chupas contra Diego de Almagro el 16 de septiembre de 1542. 11 de marzo de 1543. (261).

48. Probanza de méritos y servicios del Capitán Vasco de Guevara. 20 de marzo de 1543. (263).

49. Real cédula en recomendación de Paulo Inga. 28 de septiembre de 1543. (277).

50. Declaración de Alonso de Huete sobre la batalla que se dio en el Perú entre el Licenciado Vaca de Castro y don Diego de Almagro. Sin fecha. 1543. (278).

51. Declaración que se tomó de orden del Consejo de Indias a Juan de Uscategui, natural de Orduña, que acababa de llegar del Perú y de ser testigo de vista de lo que había acaecido en el Cuzco entre don Diego de Almagro y el Licenciado Vaca de Castro, y refiere lo que ha presenciado. 9 de agosto de 1543. (273).

52. Causa contra Juan Rodríguez Barragán. Marzo de 1543. (283).