1.  Contrato entre Pizarro, Almagro y Luque. 10 de marzo de 1526. (1).

2.  Probanza hecha en Panamá, a pedimento de Diego de Almagro. 14 de diciembre de 1526. (6).

3. Real cédula de recomendación a favor de los capitanes Francisco Pizarro y Diego de Almagro. 5 de junio de 1528. (47).

4. Capitulación celebrada con Pizarro y Almagro. 26 de julio de 1529. (48).

5. Real cédula de hidalguía a favor de Diego de Almagro. 26 de julio de 1529. (56).

6. Real cédula en que se hace merced a Diego de Almagro de la tenencia de la fortaleza de la ciudad de Tumbez. 26 de julio de 1529. (58),

7. Probanza para ante S. C. C. R. M. el Emperador y Rey nuestro señor, a pedimento del Capitán Diego de Almagro, vecino de Panamá de estos reinos de Castilla del Oro de Tierra Firme. 13 de abril de 1531. (60).

8. Real cédula nombrando a Diego de Almagro Contador de la provincia de Tierra Firme. 12 de marzo de 1532. (159).

9. Real cédula concediendo a Diego de Almagro el título de Mariscal. 1º de julio de 1532. (161).

10. Real cédula facultando a Diego de Almagro para que los indios que tenga los pueda dejar a su hijo. 1º de julio de 1532. (163).

11. Real cédula mandando reducir cierto depósito de que se había hecho responsable a Diego de Almagro. 11 de julio de 1532. (164).

12. Real cédula participando a Diego de Almagro que se ha resuelto no proveer las solicitudes por las que se ofrece ir a descubrir y conquistar las tierras que hubiese de provincia de Chincha en adelante. 11 de julio de 1532. (165).

13. Carta a Su Majestad del maestreescuela de la Catedral de Panamá don Fernando de Luque, electo obispo del Perú, dando gracias por su presentación para aquel Obispado y exponiendo las causas porque no pasó al Perú con Almagro. 20 de octubre de 1532. (166).

14. Real cédula concediendo a Diego de Almagro cierto escudo de armas. 27 de noviembre de 1532. (169).

15. Carta de Pedro de Alvarado al Rey. 25 de abril de 1533. (172).

16. Carta del Licenciado Espinosa al Rey. 1º de octubre de 1533. (174).

17. Carta de la Audiencia de la isla Española al Rey, dándole cuenta de las grandes nuevas que se habían recibido del Perú. 10 de diciembre de 1533. (187).

18. Relación de los encuentros que tuvieron en el Perú el Adelantado Benálcazar, don Pedro de Alvarado, Almagro, Pizarro y otros capitanes. Trata sobre la entrada en el Dorado; sin fecha ni firma. 1534. (189).

19. Carta de Hernando Pizarro al Rey. 14 de enero de 1534. (192).

20. Carta del adelantado don Pedro de Alvarado a S. M. dándole cuenta de lo que le sucedió cuando saliendo de Guatemala tuvo que arribar a la gobernación de don Francisco Pizarro. 15 de enero de 1534. (193)

21. Relación de varios sucesos de la conquista del Perú. Sin fecha. (197).

22. Fragmento de carta de la Audiencia de la isla Española al Rey. 30 de enero de 1534. (212).

23. Declaración de Hernando Pizarro sobre una muerte o justicia ordenada por Diego de Almagro. 13 de marzo de 1534. (213). 

24. Real cédula autorizando a Diego de Almagro para que pueda dejar en su lugar como Contador a Diego de Parras. 22 de marzo de 1534. (215).

25. Real cédula recomendando al Gobernador de Tierra Firme que ayude y favorezca a Diego de Almagro. 18 de abril de 1534. (216).

26. Provisión de la prorrogación de las sesenta leguas de gobernación al Marqués don Francisco Pizarro sobre las doscientas que tenía. 4 de mayo de 1531. (216).

27. Carta de Diego de Almagro al Rey. 8 de mayo de 1534. (218).

28. Capitulación con don Diego de Almagro para la conquista y población de las tierras o provincias que hubiere en doscientas leguas que comiencen desde donde acaban los límites de la gobernación de don Francisco Pizarro hacia el estrecho de Magallanes. 21 de mayo de 1534. (224).

29. Real cédula nombrando a Diego de Almagro Gobernador de las tierras que descubriese y conquistase. 19 de julio de 1534. (239).

30. Real cédula a los oficiales reales de la Nueva Toledo para que no tomen ciertas cuentas a Diego de Almagro. 28 de septiembre de 1534. (243).

31. Información hecha a pedimento del Mariscal don Diego de Almagro contra el Adelantado Pedro de Alvarado sobre haberse introducido en la gobernación de don Francisco Pizarro. 12 de octubre de 1534. (244).

32. Carta de Diego de Almagro al Rey. 15 de octubre de 1534. (306).

33. Real provisión nombrando a Alonso Enríquez de Guzmán Capitán de cierta gente y armada que se despachó para la provincia de Santa Marta. 12 de diciembre de 1534. (312).

34. Concierto celebrado en el pueblo de Pachacama entre Francisco Pizarro y Diego de Almagro. 14 de enero de 1535. (315).

35. Comisión al Obispo de Tierra Firme don fray Tomás de Berlanga para que midiese las doscientas y setenta leguas de la gobernación del Marqués Pizarro y la manera cómo lo había de hacer. 31 de mayo de 1535. (318).

36. Contrato celebrado entre Pizarro y Almagro. 12 de junio de 1535. (319).

37. Poder otorgado por el Adelantado don Diego Almagro a favor de Gonzalo Hernández de Oviedo. 18 de junio de 1535. (323).

38. Poder otorgado por el adelantado don Diego de Almagro en favor de Juan Espinosa. 18 de junio de 1535. (326).

39. Real cédula para que Pizarro no entre en la gobernación de Diego de Almagro. 17 de diciembre de 1535. (327).

40. Carta del Obispo de Tierra Firme don Tomás de Berlanga al Rey sobre las diferencias que encontró entre los gobernadores Francisco Pizarro y Diego de Almagro y otros particulares. 3 de febrero de 1536. (329).

41. Carta a S. M. del Licenciado Gaspar de Espinosa, dándole cuenta de una expedición de Almagro, 160 leguas adelante del Cuzco, en una provincia muy rica, etc. 25 de febrero de 1536. (341). 

42. Real cédula dirigida al obispo de Tierra Firme para que envíe relación de las fortalezas cuya tenencia pretendía Diego de Almagro. 11 de marzo de 1536. (343).

43. Capitulación con Almagro y Pizarro sobre el descubrimiento de ciertas islas del paraje de sus gobernaciones. 13 de marzo de 1536. (343).

44. Carta del Licenciado Espinosa al Rey sobre asuntos de población y gobierno. 1º de abril de 1536. (346).

45. Carta a S. M. del Adelantado don Pedro de Alvarado sobre las contrariedades que sufría de Pizarro, y estado de los descubrimientos en Guatemala. 12 de mayo de 1536. (350).

46. Carta de la Audiencia de la isla Española al Rey. 8 de septiembre de 1536. (364).

47. Traslado de una real provisión de la Audiencia de Santo Domingo para que Diego de Fuenmayor vaya por caudillo de la gente armada que iba al Perú, donde gobernaba el Mariscal don Diego de Almagro. 23 de octubre de 1536. (368).

48. A Pizarro y Almagro y don Pedro de Mendoza que guarden los límites de sus gobernaciones. 3 de noviembre de 1536. (373).

49. De oficio al Gobernador Francisco Pizarro. Sobre el nombramiento de la persona que tenga la gobernación de la provincia de Toledo, muerto Almagro. 3 de noviembre de 1536. (375).

50. Real cédula de oficio al Obispo del Perú acerca del nombramiento de la persona que ha de suceder a Almagro en su gobernación. 3 de noviembre de 1536. (376).

51. Carta del Obispo, Presidente y oidores de la isla Española a S. M. 4 de noviembre de 1536. (377).

52. Real cédula a Francisco Pizarro, encargándole la remisión de cierto oro y que favorezca a Diego de Almagro. 6 de noviembre de 1536. (381).

53. Real cédula a Francisco Pizarro tocante a varios sucesos y encargándole que envíe nuevas del viaje de Diego de Almagro. 1º de enero de 1537. (383).

54. Real cédula sobre una licencia solicitada por Rodrigo Orgoñez. 3 de febrero de 1537. (385).

55. Información rendida en el Cuzco para determinar los límites de las gobernaciones de Pizarro y Almagro. 17 de abril de 1537. (385).

56. Acta del recibimiento de Diego de Almagro por el Cabildo del Cuzco. 18 de abril de 1537. (398).

57. Fragmentos de una cartarelación de los oidores de la Española al rey. 30 de mayo de 1537. (399).

58. Probanza a instancia del Procurador mayor de Lima, sobre haber vuelto don Diego de Almagro al Cuzco con gente armada, haciendo graves daños y perjuicios. 24 de septiembre de 1537. (418).